Template:SwissregulonMotif: Difference between revisions
From FANTOM5_SSTAR
(Created page with "{|style="background-color: #F5F5F5; width:25em; float: right;" ! colspan="2" style="text-align: center; background-color: skyblue;" | [[motif_name::{{{name}}}]] |- ! [[Prope...") |
No edit summary |
||
| (89 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
<div width=250 style="float:left;"> | |||
recognized by | |||
{{#arraymap:{{{associated_transcription_factors}}}|;|$| | |||
<span> | |||
* {{#explode:$|:|2}} ( [[EntrezGene:{{#explode:$|:|1}}]]{{#set:EntrezGene={{#explode:$|:|1}}}} ) | |||
</span> | |||
|}} | |||
(data source: {{{datasource}}}) | |||
</div> | |||
<div style="float:left;"> | |||
<html><img src="/resource_browser/seqlogos/</html>{{{name}}}<html>.png" width=500> </html> | |||
<br> | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" style="width:500px" | |||
! Motif matrix | |||
|- | |- | ||
| <table cellspacing="0" border="1"><tr><td>{{#replace:{{#replace:{{{weight_matrix}}}|;|</td></tr><tr><td>}}|:|</td><td>}}</tr></table> | |||
|} | |} | ||
</div> | |||
<div style="clear:both;"></div> | |||
== Motif Activities (MARA) on Phase1 data == | |||
<html> | <html> | ||
< | <script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.js"></script> | ||
<script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.threshold.multiple.js"></script> | |||
<script language="javascript" type="text/javascript" src="/resource_browser/rb_js/flot/jquery.flot.axislabels.js"></script> | |||
</html> | </html> | ||
{{#if:{{{motif_activities_hg19}}}| | |||
'''hg19''' | |||
{{#motifmaraP1table_hg19:{{{motif_activities_hg19}}}}} | |||
{{MotifActivitiesInMaraPhase1_hg19|{{{motif_activities_hg19}}}}} | |||
}} | |||
---- | |||
{{#if:{{{motif_activities_mm9}}}| | |||
'''mm9''' | |||
{{#motifmaraP1table_mm9:{{{motif_activities_mm9}}}}} | |||
{{MotifActivitiesInMaraPhase1_mm9|{{{motif_activities_mm9}}}}} | |||
}} | |||
== GOStat results on predicted Motif target == | |||
{{#if: {{#pos:{{{gostat_on_mara_hg19}}}|GO}} | | |||
<table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">hg19</th></tr><tr><td> | |||
<div style="height:300px; overflow-y:scroll; resize:both;"> | |||
{{#motif_gotable:{{{gostat_on_mara_hg19}}}}} | |||
</div></td></tr></table> | |||
}} | |||
{{#if: {{#pos:{{{gostat_on_mara_mm9}}}|GO}} | | |||
<table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">mm9</th></tr><tr><td> | |||
<div style="height:300px; overflow-y:scroll; resize:both;"> | |||
{{#motif_gotable:{{{gostat_on_mara_mm9}}}}} | |||
</div></td></tr></table> | |||
}} | |||
<div style="clear:both;"></div> | |||
< | |||
" | |||
{{#set:name={{{name}}}}} | |||
{{#arraymap:{{{associated_transcription_factors|}}}|;|x|{{#set:associated_transcription_factors=x}}}} | {{#arraymap:{{{associated_transcription_factors|}}}|;|x|{{#set:associated_transcription_factors=x}}}} | ||
[[Category:SwissregulonMotif]] | |||
[[Category:Motif]] | |||
Latest revision as of 16:35, 2 October 2013
recognized by
- ( [[EntrezGene:]] )
(data source: {{{datasource}}})
| Motif matrix | |
|---|---|
|
Motif Activities (MARA) on Phase1 data
hg19
| Chart |
|---|
|
Sample of clicked point: |
mm9
| Z-value table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Chart |
|---|
|
Sample of clicked point: |
