MacroAPE 1083:EBNA1 Raji-EBNA1-ChIP-Seq(GSE30709)/Homer
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: EBNA1_Raji-EBNA1-ChIP-Seq(GSE30709)/Homer
_Homer.png)
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GCR2#MA0305.1 | -10 | 0.00116874 | 0.556319 | 0.672494 | 7 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | GCTTCCT | + |
| RTG3#MA0376.1 | 2 | 0.00161379 | 0.768165 | 0.672494 | 18 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | GACTAAGCACGTGCTAATAT | - |
| MGA1#MA0336.1 | 0 | 0.00444613 | 2.11636 | 0.978389 | 20 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | TTTAGAGTGTTCTATAGTCCT | - |
| twi#MA0249.1 | -2 | 0.00554359 | 2.63875 | 0.978389 | 12 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | TCGCATATGTTG | + |
| Pax4#MA0068.1 | 4 | 0.00762184 | 3.628 | 1 | 20 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | GAAAAATTTCCCATACTCCACTCCCCCCCC | + |
| SPI1#MA0080.1 | -11 | 0.0115851 | 5.5145 | 1 | 6 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | CTTCCG | - |
| Ar#MA0007.1 | 0 | 0.0124609 | 5.93138 | 1 | 20 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | ATAAGAACACCCTGTACCCGCC | + |
| ESR1#MA0112.2 | 2 | 0.0163369 | 7.77639 | 1 | 18 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | AGGTCAGGGTGACCTGGGCC | - |
| Myf#MA0055.1 | -2 | 0.0187068 | 8.90444 | 1 | 12 | GGCAGCATATGCTACCCAGG | CAGCAGCTGCTG | - |
