MacroAPE 1083:YTGGTCCTGVT,motif924
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: YTGGTCCTGVT,motif924,CNhs11995,T:168.0(6.68%),B:1759.9(2.56%),P:1e-27
| Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Zfx#MA0146.1 | 5 | 0.00348521 | 1.65896 | 1 | 9 | CTGGTCCTGGT | GGGGCCGAGGCCTG | + |
| REST#MA0138.2 | 9 | 0.0112304 | 5.34567 | 1 | 10 | CTGGTCCTGGT | GCGCTGTCCATGGTGCTGA | + |
| REST#MA0138.2 | 10 | 0.0112546 | 5.35718 | 1 | 11 | CTGGTCCTGGT | GGCGCTGTCCATGGTGCTGAA | - |
| NFE2L1::MafG#MA0089.1 | -3 | 0.0163596 | 7.78716 | 1 | 6 | CTGGTCCTGGT | GTCATG | - |
| HAP4#MA0315.1 | 0 | 0.0166499 | 7.92535 | 1 | 11 | CTGGTCCTGGT | TCGCCTCTGATTGGT | - |
