MacroAPE 1083:CNhs12345 bu f2
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: CNhs12345_bu_f2
Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AFT2#MA0270.1 | -3 | 0.00400244 | 1.90516 | 1 | 8 | AGGGTGGTGTGT | GGGGTGTG | - |
RREB1#MA0073.1 | 3 | 0.00496062 | 2.36125 | 1 | 12 | AGGGTGGTGTGT | TGGGGGGGGGTGGTTTGGGG | - |
Pax4#MA0068.1 | 6 | 0.00570461 | 2.7154 | 1 | 12 | AGGGTGGTGTGT | GGGGGGGGAGTGGAGTATTGGAAATTTTTC | - |
En1#MA0027.1 | -1 | 0.00711855 | 3.38843 | 1 | 11 | AGGGTGGTGTGT | AAGTAGTGCCC | + |
BRCA1#MA0133.1 | -3 | 0.0103637 | 4.93313 | 1 | 7 | AGGGTGGTGTGT | GTGTTGT | - |
ADR1#MA0268.1 | -3 | 0.0129994 | 6.18773 | 1 | 7 | AGGGTGGTGTGT | GTGGGGT | - |
YPR022C#MA0436.1 | -2 | 0.0162173 | 7.71945 | 1 | 7 | AGGGTGGTGTGT | CGTGGGG | - |
NFE2L2#MA0150.1 | -4 | 0.0163112 | 7.76413 | 1 | 8 | AGGGTGGTGTGT | TGCTGAGTCAT | - |
YGR067C#MA0425.1 | 4 | 0.0164958 | 7.85198 | 1 | 10 | AGGGTGGTGTGT | TGAAAAAGTGGGGT | - |
Klf4#MA0039.2 | 0 | 0.0183309 | 8.72551 | 1 | 10 | AGGGTGGTGTGT | TGGGTGGGGC | + |
MET31#MA0333.1 | 0 | 0.0196906 | 9.37273 | 1 | 9 | AGGGTGGTGTGT | GGTGTGGCG | + |
AFT1#MA0269.1 | 2 | 0.0201117 | 9.57317 | 1 | 12 | AGGGTGGTGTGT | CCAATCGGGTGCAATATGTAA | - |
GCN4#MA0303.1 | 0 | 0.0201117 | 9.57317 | 1 | 12 | AGGGTGGTGTGT | CAAGGGATGAGTCATACTTCA | + |