MacroAPE 1083:TP53 Saos-p53-ChIP-Seq/Homer
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: TP53_Saos-p53-ChIP-Seq/Homer
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TP53#MA0106.1 | -1 | 6.84487e-10 | 3.25816e-07 | 6.48715e-07 | 19 | GACATGTCCAGACATGTCCC | ACATGCCCGGGCATGTCCGG | - |
| Tcfcp2l1#MA0145.1 | -2 | 0.00050241 | 0.239147 | 0.133688 | 14 | GACATGTCCAGACATGTCCC | CTGGTTTGAACTGG | - |
| ARO80#MA0273.1 | 0 | 0.00121261 | 0.577204 | 0.229848 | 20 | GACATGTCCAGACATGTCCC | GATAATTCTCGGCAAGTATGT | + |
| sd#MA0243.1 | -6 | 0.00221415 | 1.05394 | 0.318538 | 12 | GACATGTCCAGACATGTCCC | CCGAGGAATGTC | - |
| Zfx#MA0146.1 | -2 | 0.00430816 | 2.05068 | 0.500705 | 14 | GACATGTCCAGACATGTCCC | GGGGCCGAGGCCTG | + |
| GSM1#MA0308.1 | -1 | 0.0102975 | 4.90162 | 0.887215 | 19 | GACATGTCCAGACATGTCCC | TATACTCCGGAGTTTTTTAAT | - |
| znf143#MA0088.1 | -2 | 0.0151534 | 7.213 | 0.995524 | 18 | GACATGTCCAGACATGTCCC | GATTTCCCATAATGCCTTGC | + |
| Pax4#MA0068.1 | 3 | 0.0180225 | 8.57869 | 0.995524 | 20 | GACATGTCCAGACATGTCCC | GAAAAATTTCCCATACTCCACTCCCCCCCC | + |
