MacroAPE 1083:ZN423 f1
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: ZN423_f1
| Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Zfp423#MA0116.1 | 0 | 6.00284e-07 | 0.000285735 | 0.000570723 | 15 | GGCACCCAAGGGTGC | GGCACCCAGGGGTGC | + |
| PLAG1#MA0163.1 | 0 | 8.29977e-05 | 0.0395069 | 0.0263034 | 14 | GGCACCCAAGGGTGC | GGGGCCCAAGGGGG | + |
| EBF1#MA0154.1 | -3 | 0.00021078 | 0.100331 | 0.0500999 | 10 | GGCACCCAAGGGTGC | ACCCAAGGGA | + |
| Pax5#MA0014.1 | 2 | 0.0057894 | 2.75575 | 0.733555 | 15 | GGCACCCAAGGGTGC | CCGCTACGCTTCAGTGCTCT | - |
| Pax6#MA0069.1 | -2 | 0.00721709 | 3.43533 | 0.733555 | 13 | GGCACCCAAGGGTGC | AACTCATGCGTGAA | - |
| AFT2#MA0270.1 | 0 | 0.00725222 | 3.45206 | 0.733555 | 8 | GGCACCCAAGGGTGC | CACACCCC | + |
| TBF1#MA0403.1 | -6 | 0.0155481 | 7.40088 | 0.998691 | 8 | GGCACCCAAGGGTGC | TTAGGGTT | - |
| CTCF#MA0139.1 | 2 | 0.0168325 | 8.01225 | 0.998691 | 15 | GGCACCCAAGGGTGC | TGGCCACCAGGGGGCGCTA | + |
| Kr#MA0452.1 | -4 | 0.0204438 | 9.73127 | 0.998691 | 11 | GGCACCCAAGGGTGC | CAAAAGGGTTA | + |
